Contractonderzoek

Hebt u een methode te ontwikkelen, een biologische vraag op te lossen of moleculaire gegevens te analyseren?

Progenus ondersteunt u bij het ontwerpen en uitvoeren van onderzoeks- en ontwikkelingsprojecten in de moleculaire biologie, van de haalbaarheidsstudie tot de analyse van de resultaten en, indien dit aansluit bij uw project, de overdracht van de methode naar een gebruiksklare kit.

 

Aller vers le bas

Diensten op maat

Elk project start met een analyse van uw doelstelling, uw stalen en uw specifieke vereisten.

Ons team ontwikkelt oplossingen die zijn afgestemd op uw toepassing: ontwikkeling van een detectiemethode, karakterisering van een organisme, generatie en analyse van sequentiegegevens, optimalisatie van een protocol of overdracht van een methode voor routinematig gebruik.

Wij kunnen een specifieke projectfase uitvoeren of u gedurende het volledige traject begeleiden, waarbij we indien nodig aanvullende partners inschakelen.

 

Onze onderzoeksdiensten

DNA- en RNA-moleculaire analyses

Wij ontwikkelen maatwerkmethoden die zijn afgestemd op uw stalen en onderzoeksdoelstellingen, waaronder:

  • DNA- en RNA-extractie;
  • PCR en qPCR;
  • multiplex-PCR;
  • isotherme PCR, waaronder LAMP en CPA;
  • fragmentanalyse en moleculaire profilering;
  • ontwikkeling van SSR-moleculaire merkers (microsatellieten);
  • gerichte sequencing.

Mogelijke toepassingen:

  • detectie en kwantificatie van dierlijke, plantaardige, bacteriële, schimmel- of virale soorten in specifieke matrices;
  • detectie van genetische mutaties van belang;
  • ontwikkeling van analysekits voor gebruik in het laboratorium of in het veld;
  • genetische profilering (DNA-fingerprinting) en verwantschapstesten;
  • moleculaire identificatie van soorten.

High-throughput sequencing (NGS) enBio-informatische analyses

Wij begeleiden u vanaf de opzet van de experimentele strategie tot en met de analyse van de resultaten, waaronder:

  • voorbereiding en kwaliteitscontrole van nucleïnezuren;
  • voorbereiding van sequencingbibliotheken (libraries) en sequencing met short reads of long reads;
  • kwaliteitscontrole en bio-informatische analyse van sequencinggegevens;
  • opmaak van wetenschappelijke figuren en rapporten.

Mogelijke toepassingen:

  • whole-genome sequencing (WGS);
  • whole-exome sequencing (WES) bij dieren;
  • ampliconsequencing;
  • RNA-, microRNA- en small RNA-sequencing;
  • karakterisering van pathogenen;
  • opbouw en analyse van fylogenetische bomen;
  • moleculaire identificatie en vergelijkende sequentieanalyse.

 

Dan maken we een afspraak

Ons CRO-proces

Co-creatie, ontwikkeling en uitvoering van het project

We starten met het samen definiëren van de wetenschappelijke vraag, het verwachte resultaat en de projectvereisten.

Tijdens de uitvoering houden we u op de hoogte van de behaalde resultaten en eventuele noodzakelijke aanpassingen. Belangrijke beslissingen worden in overleg met u genomen, zodat het project steeds afgestemd blijft op uw doelstellingen.

Wanneer de ontwikkelde methode bedoeld is voor routinematig gebruik, kunnen wij ook de overdracht naar een gebruiksklare PCR-kit onderzoeken, verpakt in buisjes of voorgevulde platen, binnen een kwaliteitsomgeving die gecertificeerd is volgens ISO 13485.

Na afloop van het project worden de resultaten gepresenteerd in een duidelijke en bruikbare vorm: een technisch rapport, geanalyseerde gegevens, vergelijkende tabellen, figuren of aanbevelingen voor de verdere ontwikkeling.

Onze infrastructuur

Onze laboratoria beschikken over de nodige apparatuur voor de ontwikkeling en uitvoering van projecten in de moleculaire biologie:

  • platformen voor conventionele PCR en real-time kwantitatieve PCR (qPCR);
  • capillaire sequencers;
  • Oxford Nanopore Technologies (ONT) high-throughput sequencingplatform (NGS);
  • geautomatiseerde systemen voor de extractie van nucleïnezuren;
  • apparatuur voor de voorbereiding en kwaliteitscontrole van stalen;
  • laboratorium met bioveiligheidsniveau 2 (BSL-2);
  • eenheid voor de ontwikkeling en productie van PCR-kits;
  • platform voor fluorescentie-, luminescentie- en absorbantiemetingen.

Dankzij deze infrastructuur kunnen wij projecten aanpassen aan uiteenlopende staaltypes en verschillende analytische benaderingen combineren.

 

Enkele projecten en samenwerkingen

Europees DETECTIVE-project

Progenus is partner van DETECTIVE, Detection of NGT products to promote innovation in Europe, een Horizon Europe-project dat wordt gefinancierd door de Europese Unie.

In het kader van dit project ontwikkelt Progenus moleculaire methoden om organismen die via genoombewerking zijn verkregen, te detecteren en te kwantificeren.

DIADENO-project

Progenus coördineert DIADENO, een BioWin-project dat wordt uitgevoerd in samenwerking met Yuma, UCLouvain en ULiège, met operationele en financiële steun van BioWin en SPW-EER.

Het project combineert next-generation sequencing, bio-informatica en artificiële intelligentie om een moleculaire signatuur te identificeren en een minimaal invasieve test te ontwikkelen voor de detectie van een chronische gynaecologische aandoening.

Genoom Ardense paard

In samenwerking met het Europees Paardencentrum van Mont-le-Soie heeft Progenus het eerste referentiegenoom van het Ardense trekpaard opgesteld met behulp van de-novosequencing en PacBio-long-readtechnologie. Progenus heeft ook de genetische diversiteit van het ras onderzocht aan de hand van Illumina-sequencinggegevens.

Geïnteresseerd in onze expertise?

Dan maken we een afspraak