Recherche contractuelle

Vous avez une méthode à développer, une question biologique à résoudre ou des données moléculaires à exploiter?

Progenus vous accompagne dans la conception et la réalisation de projets de recherche et développement en biologie moléculaire, depuis l’étude de faisabilité jusqu’à l’analyse des résultats et, si cela correspond à votre projet, au transfert de la méthode vers un kit prêt à l’emploi.

 

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Des services sur mesure

Chaque projet commence par l’analyse de votre objectif, de vos échantillons et de vos contraintes.

Notre équipe développe des solutions adaptées à votre application : mise au point d’une méthode de détection, caractérisation d’un organisme, génération et analyse de données de séquençage, optimisation d’un protocole ou transfert d’une méthode vers une utilisation régulière.

Nous pouvons intervenir sur une étape précise ou vous accompagner tout au long du projet, en mobilisant si nécessaire des partenaires complémentaires.

 

Nos services pour la recherche

Analyses moléculaires ADN et ARN

Nous développons des méthodes sur mesure adaptées à vos échantillons et à vos objectifs :

  • extraction d’ADN et d’ARN ;
  • PCR et qPCR ;
  • PCR multiplex ;
  • PCR isotherme, notamment LAMP et CPA ;
  • analyse de fragments et de profils moléculaires ;
  • développement de marqueurs moléculaires de type SSR (microsatellites) ;
  • séquençage ciblé.

Applications possibles :

  • détection et quantification d’espèces animales, végétales, bactériennes, fongiques ou virales dans des matrices spécifiques ;
  • détection de mutations génétiques d’intérêt ;
  • développement de kits d’analyse pour une utilisation en laboratoire ou sur le terrain ;
  • établissement d’empreintes génétiques et réalisation de tests de filiation ;
  • identification moléculaire d’espèces.

Séquençage haut débit et analyses bioinformatiques

Nous pouvons vous accompagner depuis la définition de la stratégie expérimentale jusqu’à l’analyse des résultats :

  • préparation et contrôle qualité des acides nucléiques ;
  • préparation des bibliothèques de séquençage (libraires) et séquençage short reads ou long reads;
  • contrôle qualité et analyse bio-informatique des données ;
  • création de figures et de rapports scientifiques.

Applications possibles :

  • séquençage de génomes complets ;
  • séquençage d’exomes complets chez l’animal ;
  • séquençage d’amplicons ;
  • séquençage de l’ARN, des microARN et des petits ARN ;
  • caractérisation de pathogènes ;
  • construction et analyse d’arbres phylogénétiques.
  • identification moléculaire et analyse comparative de séquences.

 

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Notre processus de CRO

Cocréation, construction et réalisation du projet

Nous commençons par définir avec vous la question scientifique, le résultat attendu et les contraintes du projet.

Pendant la réalisation, nous vous tenons informé des résultats obtenus et des éventuelles adaptations à apporter. Les décisions importantes sont prises avec vous afin que le projet reste aligné sur vos objectifs.

Lorsque la méthode développée est destinée à une utilisation régulière, nous pouvons également étudier son transfert vers un kit PCR prêt à l’emploi, conditionné en tubes ou en plaques préremplies, dans un environnement qualité certifié ISO 13485.

À l’issue du projet, les résultats sont présentés sous une forme claire et exploitable : rapport technique, données analysées, tableaux comparatifs, figures ou recommandations pour la suite du développement.

 

Nos infrastructures

Nos laboratoires disposent des équipements nécessaires au développement et à la réalisation de projets en biologie moléculaire :

  • plateformes de PCR conventionnelle et de PCR quantitative en temps réel ;
  • séquenceurs capillaires ;
  • plateforme de séquençage haut débit (NGS) Oxford Nanopore Technologies (ONT);
  • automates d’extraction des acides nucléiques ;
  • équipements de préparation et de contrôle qualité des échantillons ;
  • laboratoire de biosécurité de niveau 2 ;
  • unité de développement et de production de kits PCR ;
  • plateforme de lecture en fluorescence, luminescence et absorbance ;

Ces infrastructures nous permettent d’adapter les projets à différents types d’échantillons et de combiner plusieurs approches analytiques.

 

Quelques projets et collaborations

Projet européen DETECTIVE

Progenus est partenaire de DETECTIVE — Detection of NGT products to promote innovation in Europe, un projet Horizon Europe financé par l’Union européenne.

Dans ce cadre, Progenus développe des méthodes moléculaires permettant de détecter et de quantifier des organismes issus de l’édition génomique.

Génome du cheval ardennais

En collaboration avec le Centre européen du cheval, Progenus a réalisé le premier génome de référence du cheval de trait ardennais par séquençage de novo en technologie long reads PacBio et a également étudié la diversité génétique de la race à partir de données de séquençage Illumina.

Projet DIADENO

Progenus coordonne DIADENO, un projet BioWin mené en collaboration avec Yuma, l’UCLouvain et l’ULiège, avec le soutien opérationnel et financier de BioWin et du SPW-EER.

Le projet combine le séquençage de nouvelle génération, la bio-informatique et l’intelligence artificielle afin d’identifier une signature moléculaire et de développer un test peu invasif pour détecter une maladie gynécologique chronique.

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