Ricerca contrattuale
Avete bisogno di sviluppare un metodo, rispondere a una domanda biologica o valorizzare dati molecolari?
Progenus vi supporta nella progettazione e nello svolgimento di progetti di ricerca e sviluppo nel campo della biologia molecolare, dallo studio di fattibilità all'analisi dei risultati e, quando il progetto lo richiede, al trasferimento del metodo in un kit pronto all'uso.


Servizi su misura
Ogni progetto inizia con un'analisi dei vostri obiettivi, dei campioni e dei vincoli tecnici.
Il nostro team sviluppa soluzioni personalizzate per la vostra applicazione: sviluppo di un metodo di rilevazione, caratterizzazione di un organismo, generazione e analisi di dati di sequenziamento, ottimizzazione di un protocollo o trasferimento di un metodo per l'utilizzo routinario.
Possiamo intervenire in una fase specifica del progetto oppure accompagnarvi durante l'intero percorso, coinvolgendo, se necessario, partner complementari.
I nostri servizi di ricerca
Analisi molecolari di DNA e RNA
Sviluppiamo metodi personalizzati, adattati ai vostri campioni e ai vostri obiettivi, tra cui:
- estrazione di DNA e RNA;
- PCR e qPCR;
- PCR multiplex;
- PCR isotermica, inclusi LAMP e CPA;
- analisi dei frammenti e dei profili molecolari;
- sviluppo di marcatori molecolari SSR (microsatelliti);
- sequenziamento mirato.
Possibili applicazioni:
- rilevazione e quantificazione di specie animali, vegetali, batteriche, fungine o virali in matrici specifiche;
- rilevazione di mutazioni genetiche di interesse;
- sviluppo di kit di analisi per applicazioni in laboratorio o sul campo;
- identificazione genetica (genetic fingerprinting) e test di parentela;
- identificazione molecolare delle specie.
Sequenziamento ad alta processività (NGS) e analisi bioinformatiche
Vi supportiamo dalla definizione della strategia sperimentale fino all'analisi dei risultati, includendo:
- preparazione e controllo qualità degli acidi nucleici;
- preparazione delle librerie di sequenziamento e sequenziamento con tecnologie short-read o long-read;
- controllo qualità e analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento;
- realizzazione di figure e report scientifici.
Possibili applicazioni:
- sequenziamento dell'intero genoma (Whole Genome Sequencing, WGS);
- sequenziamento dell'intero esoma negli animali (Whole Exome Sequencing, WES);
- sequenziamento di ampliconi;
- sequenziamento di RNA, microRNA e small RNA;
- caratterizzazione di patogeni;
- costruzione e analisi di alberi filogenetici;
- identificazione molecolare e analisi comparativa delle sequenze.

Il nostro processo CRO
Co-progettazione, sviluppo e realizzazione del progetto
Iniziamo definendo insieme a voi la domanda scientifica, i risultati attesi e i vincoli del progetto.
Durante lo svolgimento del progetto vi teniamo costantemente aggiornati sui risultati ottenuti e sugli eventuali adattamenti necessari. Le decisioni più importanti vengono prese insieme a voi, affinché il progetto rimanga pienamente allineato ai vostri obiettivi.
Quando il metodo sviluppato è destinato a un utilizzo routinario, possiamo valutarne il trasferimento in un kit PCR pronto all'uso, confezionato in provette o piastre preriempite e prodotto in un sistema di gestione della qualità certificato ISO 13485.
Al termine del progetto, i risultati vengono presentati in un formato chiaro e facilmente utilizzabile: report tecnico, dati analizzati, tabelle comparative, figure o raccomandazioni per le fasi successive dello sviluppo.
Le nostre infrastrutture
I nostri laboratori dispongono delle apparecchiature necessarie per lo sviluppo e la realizzazione di progetti di biologia molecolare:
- piattaforme per PCR convenzionale e PCR quantitativa in tempo reale (qPCR);
- sequenziatori capillari;
- piattaforma di sequenziamento di nuova generazione (NGS) Oxford Nanopore Technologies (ONT);
- sistemi automatizzati per l'estrazione degli acidi nucleici;
- apparecchiature per la preparazione dei campioni e il controllo qualità;
- laboratorio di biosicurezza di livello 2 (BSL-2);
- unità per lo sviluppo e la produzione di kit PCR;
- piattaforma per misure di fluorescenza, luminescenza e assorbanza.
Queste infrastrutture ci consentono di adattare i progetti a diversi tipi di campioni e di combinare molteplici approcci analitici all'interno dello stesso progetto.

Alcuni progetti e collaborazioni
Progetto europeo DETECTIVE
Progenus è partner di DETECTIVE, Detection of NGT products to promote innovation in Europe, un progetto Horizon Europe finanziato dall’Unione europea.
Nell’ambito di questo progetto, Progenus sviluppa metodi molecolari per rilevare e quantificare gli organismi ottenuti mediante editing genomico.

Genoma del cavallo Ardennese
In collaborazione con il Centro europeo del cavallo di Mont-le-Soie, Progenus ha realizzato il primo genoma di riferimento del cavallo da tiro Ardennese mediante sequenziamento de novo con tecnologia PacBio long-read.
Progenus ha inoltre studiato la diversità genetica della razza a partire da dati di sequenziamento Illumina.

Progetto DIADENO
Progenus coordina DIADENO, un progetto BioWin realizzato in collaborazione con Yuma, UCLouvain e ULiège, con il sostegno operativo e finanziario di BioWin e dello SPW-EER.
Il progetto combina il sequenziamento di nuova generazione, la bioinformatica e l’intelligenza artificiale per identificare una firma molecolare e sviluppare un test minimamente invasivo per la diagnosi di una malattia ginecologica cronica.

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